RNA–Protein interactions for RNA: YML005W

TRM12, Transcript of S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, yeast

Gene TRM12, Length 1,389 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM12	YML005W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM12	YML005W	GAS5	Q08193	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM12	YML005W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM12	YML005W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	NFS1	P25374	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	KIP1	P28742	1111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	PET10	P36139	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YFL054C	P43549	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	VPS53	P47061	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SPO21	Q12411	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SAC7	P17121	654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SFP1	P32432	683 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	AFR1	P33304	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YKR073C	P36153	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	LAP2	Q10740	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	MDM12	Q92328	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TRP3	P00937	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	DOM34	P33309	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YKL151C	P36059	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	DSS1	P39112	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	NPP1	P25353	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	PPH3	P32345	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	CDC11	P32458	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	GEM1	P39722	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SIT1	P39980	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	CTH1	P47976	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	HLJ1	P48353	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	FOL1	P53848	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YNL193W	P53870	558 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	RAD53	P22216	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	VBA3	P25594	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YRO2	P38079	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	HSE1	P38753	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TOK1	P40310	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YJL045W	P47052	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	GPG1	P53130	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TRM12	YML005W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
TRM12	YML005W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	GPT2	P36148	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	ALG2	P43636	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YJR120W	P47157	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	YGR237C	P50089	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	DSE4	P53753	1117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	THI73	Q07904	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	NUP145	P49687	1317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	CDC9	P04819	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SFA1	P32771	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	ELM1	P32801	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	SLA2	P33338	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	RRM3	P38766	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	GYP8	P43570	497 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TPO2	P53283	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TMA17	Q12513	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRM12	YML005W	TOP1	P04786	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	PRO1	P32264	428 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	PAF1	P38351	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	NPP2	P39997	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	EAR1	Q03212	550 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	LCD1	Q04377	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	MED7	Q08278	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	ADE8	P04161	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SPC29	P33419	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	GRX7	P38068	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	PMT3	P47190	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	UME1	Q03010	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	ACM1	Q08981	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SRD1	P09007	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	SNF5	P18480	905 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	MRC1	P25588	1096 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	UGA2	P38067	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TRM12	YML005W	MGS1	P40151	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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