RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RDS1	P25611	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CBF2	P32504	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CNS1	P33313	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	FES1	P38260	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	FZO1	P38297	855 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NPR2	P39923	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HFM1	P51979	1187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YGR266W	P53326	701 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ESBP6	P53918	673 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VPS38	Q05919	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RSC2	Q06488	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NUR1	Q12066	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CDC16	P09798	840 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RSR1	P13856	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RAD53	P22216	821 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
SKG6	YHR149C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YPT11	P48559	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MUB1	Q03162	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
SKG6	YHR149C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SQT1	P35184	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	AXL1	P40851	1208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	LAM5	P43560	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	STB2	P46679	850 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	JJJ2	P46997	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CTF18	P49956	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TEL2	P53038	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HOP2	P53187	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BOP3	P53958	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RSM24	Q03976	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HMI1	Q12039	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CDC8	P00572	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VPH2	P32341	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RMD1	Q03441	430 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	DML1	Q03652	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PPM1	Q04081	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VAC14	Q06708	880 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VIK1	Q12045	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BMT6	Q12291	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SCM3	Q12334	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RTP1	Q12751	981 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	STE6	P12866	1290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PHO13	P19881	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MSM1	P22438	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SCJ1	P25303	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	NIP100	P33420	868 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PEX5	P35056	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YKL133C	P36066	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	PSY4	P38193	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
SKG6	YHR149C	MUM2	P38236	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SMF1	P38925	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	UBP12	P39538	1254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ENT3	P47160	408 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	BRO1	P48582	844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MEH1	Q02205	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MEC3	Q02574	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	FIN1	Q03898	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	MCP2	Q06567	569 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	RKM4	Q12504	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SKG6	YHR149C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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