RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C SUL1P38359 859 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C STT3P39007 718 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ATG32P40458 529 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ORC4P54791 529 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C TRS120Q04183 1289 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C DUS4Q06063 367 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C GYP1Q08484 637 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C OXR1Q08952 273 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ERP3Q12403 225 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C ARP6Q12509 438 aa6.47□□□□□ -1.37
RRP4YHR069C THR4P16120 514 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ALG1P16661 449 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C MCM3P24279 971 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C MCM4P30665 933 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C UBP11P36026 717 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C DBP7P36120 742 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C GAA1P39012 614 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YGR153WP48238 217 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YGR125WP53273 1036 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C DSE4P53753 1117 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C BNI5P53890 448 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C FAR11P53917 953 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TFB3Q03290 321 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C AGE1Q04412 482 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TY3A-GQ12173 290 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TIP41Q12199 356 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TY3A-IQ99219 290 aa6.46□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C HXK1P04806 485 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C PWP2P25635 923 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YKR018CP36114 725 aa6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C CUE3P53137 624 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TUB4P53378 473 aa6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C AIM33Q04516 312 aa6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YOR296WQ08748 1289 aa6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C CDC19P00549 500 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RGP1P16664 663 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TKL1P23254 680 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SAS3P34218 831 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C CCT5P40413 562 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RRN7P40992 514 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C BRE2P43132 505 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C DAK2P43550 591 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C NCS6P53088 359 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YAF9P53930 226 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C OYE2Q03558 400 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YMR321CQ04898 105 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SGD1Q06132 899 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C MMR1Q06324 491 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C APC11Q12157 165 aa6.44□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ROX1P25042 368 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YUR1P26725 428 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C THI6P41835 540 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C GPD2P41911 440 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SCS3P53012 380 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SLD5Q03406 294 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C CSM3Q04659 317 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RAD59Q12223 238 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RKM4Q12504 494 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C NBL1Q3E7Y6 73 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C AIM44Q99299 758 aa6.43□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ILV1P00927 576 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TUF1P02992 437 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ISW1P38144 1129 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C REG2P38232 338 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RVS167P39743 482 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C MXR1P40029 184 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YPT11P48559 417 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C ATG1P53104 897 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RTC4P53850 401 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C MFM1Q02783 413 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.42□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C GPA1P08539 472 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YEL076C-AP0CX16 216 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YLR464WP0CX17 216 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data6.41□□□□□ -1.38not detected
RRP4YHR069C SDH2P21801 266 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C BMH1P29311 267 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C RGT1P32862 1170 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C TFC4P33339 1025 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C DID4P36108 232 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C BRL1P38770 471 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C XDJ1P39102 459 aa6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C SNF7P39929 240 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RRP4YHR069C YEL076CP39971 216 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.1 ms