RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 ADRA2BP18089 450 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 BABAM1Q9NWV8 329 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 MSL1Q68DK7 614 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 USP16Q9Y5T5 823 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 C4AP0C0L4 1744 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 CCER2I3L3R5 266 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 CHL1O00533 1208 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-226ENST00000513095 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 A1BGP04217 495 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 RFC4P35249 363 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 POLD1P28340 1107 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CCDC27Q2M243 656 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CFAP44Q96MT7 982 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 COL15A1P39059 1388 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF853P0CG23 659 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 MIER1Q8N108 512 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 ARXQ96QS3 562 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GYS1P13807 737 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 WWC1Q8IX03 1113 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 IFT57Q9NWB7 429 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 GNAI1P63096 354 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-226ENST00000513095 NBPF26B4DH59 902 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 NBPF15Q8N660 670 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 MBIPQ9NS73 344 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 NARFQ9UHQ1 456 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 A0A087WZG4 1122 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 ZPR1O75312 459 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 KRT24Q2M2I5 525 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 FKBP8Q14318 412 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 MMP10P09238 476 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.42■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 NGEFQ8N5V2 710 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 IL16Q14005 1332 aa18.41■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 SYT17Q9BSW7 474 aa18.4■□□□□ 0.54
SH3BP2-226ENST00000513095 SCN7AQ01118 1682 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 WDR63Q8IWG1 891 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 KLHL34Q8N239 644 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 ERBB4Q15303 1308 aa18.39■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 CAMTA2O94983 1202 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 HOXB7P09629 217 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 MYL6BP14649 208 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 TM4SF1P30408 202 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 PDIA6Q15084 440 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 NECTIN2Q92692 538 aa18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 DDR1Q08345 913 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 BCORQ6W2J9 1755 aa18.37■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 NFIXQ14938 502 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.36■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF521Q96K83 1311 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 ANXA1P04083 346 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 PROSER3Q2NL68 480 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.33■□□□□ 0.53
SH3BP2-226ENST00000513095 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-226ENST00000513095 TSPYL6Q8N831 410 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-226ENST00000513095 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-226ENST00000513095 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP2-226ENST00000513095 RGL2O15211 777 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP2-226ENST00000513095 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms