RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Esco1Q69Z69 843 aa30,01■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 IarsQ8BU30 1262 aa30■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc39a6Q8C145 765 aa30■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP30■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa29,99■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prr29B1ARI9 187 aa29,99■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa29,98■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Esx1O88933 382 aa29,98■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dusp27Q148W8 1138 aa29,98■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slf2Q6P9P0 1278 aa29,98■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lama4P97927 1816 aa29,97■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prdm11A2AGX3 565 aa29,97■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GckrQ91X44 587 aa29,97■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Klhdc4Q921I2 584 aa29,97■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fkbp4P30416 458 aa29,96■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Taf7Q9R1C0 341 aa29,96■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CastP51125 788 aa29,95■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Snai1Q02085 264 aa29,95■■■□□ 2,39
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zscan21Q07231 555 aa29,94■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa29,94■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Q8C6G1 249 aa29,94■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 B4galnt4Q766D5 1034 aa29,93■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Spon1Q8VCC9 807 aa29,93■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP29,93■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa29,92■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP29,92■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Stra8P70278 393 aa29,91■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rapgefl1Q68EF8 662 aa29,91■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tango6Q8C3S2 1079 aa29,91■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cyp2c68K7N6C2 491 aa29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 EgfrQ01279 1210 aa29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arid3aQ62431 601 aa29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dlg5E9Q9R9 1921 aa29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP29,9■■■□□ 2,38
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Chpf2Q3UU43 768 aa29,89■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Itgb4A2A863 1818 aa29,88■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ifit1bl2Q3U687 466 aa29,88■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adgre1Q61549 931 aa29,87■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ciapin1Q8WTY4 309 aa29,87■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Col4a5Q63ZW6 1691 aa29,86■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ambra1A2AH22 1300 aa29,86■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Klrk1O54709 232 aa29,85■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Akap2O54931 893 aa29,85■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SowahdQ8BY98 327 aa29,85■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gja5Q01231 358 aa29,84■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 SympkQ80X82 1284 aa29,84■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa29,83■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa29,83■■■□□ 2,37
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Q3TQI7 289 aaKnown RBP29,82■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Uspl1Q3ULM6 1089 aa29,82■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc34a2Q9DBP0 697 aa29,82■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Erbb4Q61527 1308 aa29,82■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Megf6Q80V70 1572 aa29,81■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mrs2Q5NCE8 434 aa29,8■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Adam1aQ60813 791 aa29,8■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa29,79■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PrimpolQ6P1E7 537 aa29,79■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trim52Q8CDV4 233 aa29,79■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 St5Q924W7 1134 aa29,78■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fam122aQ9DB52 284 aa29,78■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa29,78■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pde4bB1AWC9 736 aa29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Stox1B2RQL2 990 aa29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PsapQ61207 557 aaKnown RBP29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tmem119Q8R138 280 aa29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ssc5dQ8BV57 1371 aa29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 CltaO08585 235 aa29,77■■■□□ 2,36
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Igfbp6P47880 238 aa29,76■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NogP97466 232 aa29,76■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP29,76■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa29,75■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gnai1B2RSH2 354 aa29,75■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cd248Q91V98 765 aa29,75■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gnai3Q9DC51 354 aa29,75■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dctn1O08788 1281 aa29,74■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa29,74■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Usp16Q99LG0 825 aa29,74■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ttll7A4Q9F0 912 aa29,73■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa29,73■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trim34aQ99PP6 485 aa29,73■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dbndd1Q9CZ00 160 aa29,73■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29,73■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atf5O70191 283 aa29,72■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gimap8Q75N62 688 aa29,72■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plekhh1Q80TI1 1356 aa29,71■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Golgb1E9PVZ8 3238 aa29,71■■■□□ 2,35
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Spire2Q8K1S6 718 aa29,69■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atxn3Q9CVD2 355 aa29,69■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Npy5rO70342 466 aa29,68■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Duox1A2AQ92 1551 aa29,68■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm3043K7N693 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm16440K7N6G6 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm2244L7N2A3 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm3278L7N2D2 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm8271L7N2E2 218 aa29,67■■■□□ 2,34
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa29,67■■■□□ 2,34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23,2 ms