RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trim58Q5NCC9 485 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Disp3A3KFU9 1347 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Irf9Q61179 399 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf330Q922H9 316 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Flt4P35917 1363 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pank1Q8K4K6 548 aa15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankle2Q6P1H6 964 aa15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa15.09■□□□□ 0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slfnl1Q8BHW9 410 aa15.08■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Lrrc43Q3V0L5 667 aa15.07■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nutm1Q8BHP2 1126 aa15.07■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa15.07■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnnt3Q9QZ47 272 aa15.07■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa15.07■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ddx60E9PZQ1 1711 aa15.06■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prr29B1ARI9 187 aa15.05■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Hspa2P17156 633 aa15.05■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Map3k2Q61083 619 aa15.05■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Prr5lA2AVJ5 370 aa15.05■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam198bQ3UPI1 517 aa15.05■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Exoc6bA6H5Z3 810 aa15.04■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Csrnp3P59055 597 aa15.04■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa15.04■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MeiocA2AG06 965 aa15.03■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Strn4P58404 760 aa15.03■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ubr3Q5U430 1889 aa15.03■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Esco1Q69Z69 843 aa15.02■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 OscarQ8VBT3 265 aa15.02■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trip6Q9Z1Y4 480 aa15.02■□□□□ -0
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa15.02□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Lama4P97927 1816 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ppm1mQ8BU27 406 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MypnQ5DTJ9 1315 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Bend3Q6PAL0 825 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MvpQ9EQK5 861 aa15.01□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ssc5dQ8BV57 1371 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Atp1b3P97370 278 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 HellsQ60848 821 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dpf1Q9QX66 387 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankrd44B2RXR6 993 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NppbP40753 121 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ank1Q02357 1862 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kif23E9Q5G3 953 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slf2Q6P9P0 1278 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tspyl2Q7TQI8 677 aa15□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zfyve9A2A8R0 1397 aa14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zap70P43404 618 aa14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ddx58Q6Q899 926 aa14.99□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf521Q6KAS7 1311 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Spata31d1bE9QA57 1361 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adam1aQ60813 791 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sumf1Q8R0F3 372 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Akt1s1Q9D1F4 257 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col11a2Q64739 1736 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Jdp2P97875 163 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Snai1Q02085 264 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Amhr2Q8K592 568 aa14.98□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 AK157302I3ITR1 129 aa14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 AbraQ8BUZ1 375 aa14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Isca1Q9D924 129 aa14.97□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fkbp5Q64378 456 aa14.96□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 SowahdQ8BY98 327 aa14.96□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ifit1bl2Q3U687 466 aa14.96□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Aldh1l2Q8K009 923 aa14.96□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plch1Q4KWH5 1682 aa14.96□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Map3k13Q1HKZ5 959 aa14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NeflP08551 543 aa14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Myd88P22366 296 aa14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ripor2Q80U16 1078 aa14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Arap2Q8BZ05 1703 aa14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ubn2Q80WC1 1314 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tlr8P58682 1032 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Msl1Q6PDM1 616 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 NmiO35309 314 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Soga3Q6NZL0 945 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cwc25Q9DBF7 416 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ehd4Q9EQP2 541 aa14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fgd1P52734 960 aa14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trim34aQ99PP6 485 aa14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23 ms