RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 VRK3Q8IV63 474 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 APCDD1Q8J025 514 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHB8Q9UN66 801 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX6Q9UNH7 406 aa16.88■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 KNL1Q8NG31 2342 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2AG2A6NM03 316 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 RRM2P31350 389 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 NKX3-2P78367 333 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SMARCB1Q12824 385 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA0040Q15053 153 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 DESI1Q6ICB0 168 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 COLGALT2Q8IYK4 626 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 MFSD4AQ8N468 514 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 MUC13Q9H3R2 512 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 IL26Q9NPH9 171 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PLXNB2O15031 1838 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 APOL3O95236 402 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ABRQ12979 859 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SPRYD7Q5W111 196 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 COPS8Q99627 209 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CD244Q9BZW8 370 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SPEGQ15772 3267 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ATF6P18850 670 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PTGER3P43115 390 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH18Q13634 790 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R14BQ96C90 147 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CENPOQ9BU64 300 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 REEP1Q9H902 201 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.87■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ESR1P03372 595 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CSKP41240 450 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CRATP43155 626 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TUBA3CQ13748 450 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 DRGXA6NNA5 263 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 H3BM21 787 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CTDSP2O14595 271 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 YY2O15391 372 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TLL1O43897 1013 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SCELO95171 688 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 C7P10643 843 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SDC1P18827 310 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 FCGRTP55899 365 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 HKDC1Q2TB90 917 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB2Q8N680 514 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 NELL1Q92832 810 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 IL17CQ9P0M4 197 aa16.86■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC34A8MYJ7 566 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 FABP3P05413 133 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 LAMP1P11279 417 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH12P55289 794 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 MORN1Q5T089 497 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SPATA17Q96L03 361 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 GORASP2Q9H8Y8 452 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 USE1Q9NZ43 259 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 CKMT1AP12532 417 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 ITIH1P19827 911 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 TGM1P22735 817 aa16.85■□□□□ 0.29
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC19A1P41440 591 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms