RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	SNX4	P47057	423 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	VPS53	P47061	822 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	MPS2	P53159	387 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	ESBP6	P53918	673 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	MDM1	Q01846	1127 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	DML1	Q03652	475 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	VTI1	Q04338	217 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	COG4	Q06096	861 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	MCP2	Q06567	569 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	APC11	Q12157	165 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	GYP5	Q12344	894 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	RAV1	P47104	1357 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	BUD2	P33314	1104 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	YKL222C	P35995	705 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	YRO2	P38079	344 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	TAF5	P38129	798 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	YEL023C	P39992	682 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	FMS1	P50264	508 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	CWH41	P53008	833 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	ATG9	Q12142	997 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	OSH2	Q12451	1283 aa		5.54	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	KEX1	P09620	729 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	FUS1	P11710	512 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	KAR1	P11927	433 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	PMR1	P13586	950 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	DIT2	P21595	489 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	PEP7	P32609	515 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	GLC3	P32775	704 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	ATO2	P32907	282 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	STE13	P33894	931 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	SAS3	P34218	831 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	MET1	P36150	593 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	PIH1	P38768	344 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	SSN8	P47821	323 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	GPR1	Q12361	961 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	ESP1	Q03018	1630 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
EXO1	YOR033C	PXA2	P34230	853 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	FZO1	P38297	855 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	APS3	P47064	194 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	URB2	P47108	1174 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	NPA3	P47122	385 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	RPN4	Q03465	531 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
EXO1	YOR033C	TCB1	Q12466	1186 aa		5.53	□□□□□ -1.52
EXO1	YOR033C	JIP3	O13555	125 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	CDC16	P09798	840 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	PMS1	P14242	873 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	HNM1	P19807	563 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ITR2	P30606	609 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	MGM1	P32266	881 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SSO1	P32867	290 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SLX1	P38324	304 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YIL001W	P40560	513 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	UBP15	P50101	1230 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YDR090C	Q03193	310 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ATG17	Q06410	417 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YLH47	Q06493	454 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YRM1	Q12340	786 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	IES3	Q12345	250 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	REP1	P03871	373 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	SEC2	P17065	759 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	DPB3	P27344	201 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	TOM20	P35180	183 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	UIP5	P36137	443 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	VID27	P40157	782 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YFL066C	P43538	392 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	MDV1	P47025	714 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	RPA14	P50106	137 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	UBA2	P52488	636 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	YGR273C	P53329	174 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	IPI3	P53877	555 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EXO1	YOR033C	FDC1	Q03034	503 aa		5.51	□□□□□ -1.53

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