RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MEF2	P39677	819 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	QDR1	P40475	563 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TMA10	Q06177	86 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MCH5	Q08777	521 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YIG1	Q08956	461 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SWM1	Q12379	170 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ADE8	P04161	214 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HSF1	P10961	833 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MRPL9	P31334	269 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PPH3	P32345	308 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YSC84	P32793	468 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ORC2	P32833	620 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PEP12	P32854	288 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	OAR1	P35731	278 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	KTR4	P38131	464 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PEX28	P38848	579 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	SLS1	P42900	643 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YBP2	P53169	641 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	YAF9	P53930	226 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	ALD3	P54114	506 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.47	□□□□□ -2.33	not detected
SOV1	YMR066W	GCN5	Q03330	439 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RKM2	Q03942	479 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	HOF1	Q05080	669 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	CDA2	Q06703	312 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	PUS9	Q12069	462 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	LSO1	Q3E827	93 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SOV1	YMR066W	MRP10	O75012	95 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	STE11	P23561	717 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ATG19	P35193	415 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	APT2	P36973	181 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GEM1	P39722	662 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ALT1	P52893	592 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NUT1	P53114	1132 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TRS120	Q04183	1289 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CAB1	Q04430	367 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MCD1	Q12158	566 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HAT1	Q12341	374 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GAL10	P04397	699 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TAF13	P11747	167 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
SOV1	YMR066W	MSH3	P25336	1018 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	KIP1	P28742	1111 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RGT1	P32862	1170 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PEX7	P39108	375 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GPB2	P39717	880 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PZF1	P39933	429 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MAD1	P40957	749 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YJL045W	P47052	634 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NIT3	P49954	291 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SCS3	P53012	380 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YMR206W	Q03695	313 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SIZ1	Q04195	904 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DLT1	Q04216	342 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MRL1	Q06815	381 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PPM2	Q08282	695 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FLP1	P03870	423 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CTS1	P29029	562 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CDC11	P32458	415 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PEX2	P32800	271 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SPC42	P36094	363 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RGD1	P38339	666 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	REV7	P38927	245 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PLB1	P39105	664 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ORC3	P54790	616 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RNT1	Q02555	471 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YLR224W	Q05947	369 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PUP1	P25043	261 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	EMC1	P25574	760 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ASF1	P32447	279 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SEC8	P32855	1065 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YIL166C	P40445	542 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SHR5	P41912	237 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RGD2	P43556	714 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ATG1	P53104	897 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MRPS35	P53292	345 aa		0.45	□□□□□ -2.34

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