RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	MKK2	P32491	506 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR297W	YLR297W	YJR107W	P47145	328 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR297W	YLR297W	MRPL22	P53881	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR297W	YLR297W	ORC3	P54790	616 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YLR297W	YLR297W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	NIT1	P40447	199 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	RSC58	Q07979	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	ATG2	P53855	1592 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TAF2	P23255	1407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	COQ4	O13525	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SPS1	P08458	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MLS1	P30952	554 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	HXT13	P39924	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	HXT17	P53631	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SIW14	P53965	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	HXT15	P54854	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	RSB1	Q08417	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MMS22	Q06164	1454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	GNP1	P48813	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	BPT1	P14772	1559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	YER152C	P10356	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	CCZ1	P38273	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TNA1	P53322	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TAF13	P11747	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	RER2	P35196	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MCM7	P38132	845 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
YLR297W	YLR297W	RAD27	P26793	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	CNN1	P43618	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	CHD1	P32657	1468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SNF5	P18480	905 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TOD6	P34219	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	THI80	P35202	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TAF1	P46677	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	SNO2	P53823	222 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YLR297W	YLR297W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	ROT1	Q03691	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YLR297W	YLR297W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	PET112	P33893	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	YKL222C	P35995	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	BAP2	P38084	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	PEP1	P32319	1579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	STU1	P38198	1513 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	DNA2	P38859	1522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RGD1	P38339	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	PIK1	P39104	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	MXR1	P40029	184 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	ESC8	Q08119	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	POL1	P13382	1468 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	CMP2	P14747	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	ASF1	P32447	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	MPH1	P40562	993 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	BAS1	P22035	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	DUT1	P33317	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	SPT20	P50875	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RIM8	P53179	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YLR297W	YLR297W	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	APL1	P27351	700 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RFC5	P38251	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	LAM1	P38851	1228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	GIP4	P39732	760 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	ENT3	P47160	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	PLB2	Q03674	706 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	RSM24	Q03976	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	SGD1	Q06132	899 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLR297W	YLR297W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
YLR297W	YLR297W	SVS1	Q12254	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.1 ms