RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W LYS5P50113 272 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W TPO2P53283 614 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W TFB2Q02939 513 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W SRC1Q03707 834 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W GIC2Q06648 383 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W LAP2Q10740 671 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W HBN1Q96VH4 193 aa6.04□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W CDC11P32458 415 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W PAN5P38787 379 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W YAR028WP39548 234 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W GIP2P40036 548 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W YDR306CQ06640 478 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W SYT1Q06836 1226 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W AVO1Q08236 1176 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W GNT1Q12096 491 aa6.03□□□□□ -1.44
YKR047WYKR047W YBR284WP38150 797 aa6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W SIP5P40210 489 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W HLJ1P48353 224 aa6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YMR074CQ04773 145 aa6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YLL054CQ12244 843 aa6.02□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W TOP3P13099 656 aa6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W SCT1P32784 759 aa6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W NUG1P40010 520 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W TED1P40533 473 aa6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W MAL11P53048 616 aa6.01□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W NFS1P25374 497 aa6□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W HSE1P38753 452 aa6□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data6□□□□□ -1.45not detected
YKR047WYKR047W VPS53P47061 822 aa6□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W ATG13Q06628 738 aa6□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W ELG1Q12050 791 aa6□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W SAC7P17121 654 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W DOM34P33309 386 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W GRX7P38068 203 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W DSS1P39112 969 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W UBP6P43593 499 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YGR045CP53229 120 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W GIS4Q04233 774 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W SLP1Q12232 587 aa5.99□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YDR444WQ04093 687 aa5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YOL057WQ08225 711 aa5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YPR071WQ12346 211 aa5.98□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YER152CP10356 443 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W MSD1P15179 658 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W ERS1P17261 260 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W MEF1P25039 761 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W MET22P32179 357 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W PPH3P32345 308 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W PET10P36139 283 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W QNS1P38795 714 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YIR007WP40566 764 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W PMT3P47190 753 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YNL193WP53870 558 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W YPL260WQ08977 551 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W SPO21Q12411 609 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W MDM12Q92328 271 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W NUP145P49687 1317 aa5.97□□□□□ -1.45
YKR047WYKR047W GSY1P23337 708 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W MRC1P25588 1096 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W MAE1P36013 669 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W ALG14P38242 237 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W PNT1P38969 423 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W YGR237CP50089 785 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W FOL1P53848 824 aa5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W RAD53P22216 821 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W KIP1P28742 1111 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W PGM2P37012 569 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W YRO2P38079 344 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SIT1P39980 628 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.95□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W ADE8P04161 214 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data5.94□□□□□ -1.46not detected
YKR047WYKR047W RET1P22276 1149 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W VBA3P25594 458 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W PAF1P38351 445 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W GPB2P39717 880 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W TPM2P40414 161 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W NOP2P40991 618 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W ALG2P43636 503 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W THI73Q07904 523 aa5.94□□□□□ -1.46
YKR047WYKR047W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.93□□□□□ -1.46not detected
YKR047WYKR047W DBP2P24783 546 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms