RNA–Protein interactions for RNA: YBL003C

HTA2, Transcript of Histone H2A, yeast

Gene HTA2, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTA2	YBL003C	YJR120W	P47157	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	COG4	Q06096	861 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RGP1	P16664	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	EUG1	P32474	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PTH2	P34222	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YEL1	P34225	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	ACO2	P39533	789 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MAL11	P53048	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
HTA2	YBL003C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RAD53	P22216	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RPN12	P32496	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	ADD66	P36040	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	BAP2	P38084	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MBP1	P39678	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	CNN1	P43618	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PEX14	P53112	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	COG6	P53959	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PSH1	Q12161	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	GLO4	Q12320	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	FUS1	P11710	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
HTA2	YBL003C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MGS1	P40151	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	HNT2	P49775	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	GPG1	P53130	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	UBX4	P54730	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RKM2	Q03942	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	VBA3	P25594	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MCM7	P38132	845 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	EXO5	P38289	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RIM4	P38741	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PPT1	P53043	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YNR040W	P53736	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MDG1	P53885	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	ADE8	P04161	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PTP2	P29461	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	IES5	P40060	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	IES1	P43579	692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PIP2	P52960	996 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	CUZ1	P53899	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	COG8	Q04632	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	PSR2	Q07949	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HTA2	YBL003C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MEF1	P25039	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PET10	P36139	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MRPL16	P38064	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YBR284W	P38150	797 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	RGD1	P38339	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	ALG2	P43636	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	TGL2	P54857	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	HEH2	Q03281	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	ENT2	Q05785	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
HTA2	YBL003C	TOP3	P13099	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	DIT1	P21623	536 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PLC1	P32383	869 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	MNN4	P36044	1178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	YKL133C	P36066	463 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	PAN5	P38787	379 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	CEM1	P39525	442 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	SIT1	P39980	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HTA2	YBL003C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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