RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021306.13

Eftud2-201, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Eftud2, Length 3,324 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Fmnl2A2APV2 1086 aa10.25□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nphp4P59240 1425 aa10.25□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ipo9Q91YE6 1041 aa10.25□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ralbp1Q62172 648 aa10.24□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zpr1Q62384 459 aa10.24□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cluap1Q8R3P7 413 aa10.24□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 CanxP35564 591 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Jdp2P97875 163 aa10.23□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Slit1Q80TR4 1531 aa10.23□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa10.23□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 NppbP40753 121 aa10.23□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 P2rx7Q9Z1M0 595 aa10.23□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 MeiocA2AG06 965 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Dnajc10Q9DC23 793 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tmco5bQ80X59 307 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 FanciQ8K368 1330 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Uspl1Q3ULM6 1089 aa10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 PappaQ8R4K8 1624 aa10.21□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa10.21□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Dusp27Q148W8 1138 aa10.21□□□□□ -0.77
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rgs19Q9CX84 216 aa10.21□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Iqcf3Q9D498 203 aa10.21□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 TatQ8QZR1 454 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zfp91Q62511 572 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 EspnQ9ET47 871 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atf7ipQ7TT18 1306 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Usp19Q3UJD6 1360 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Abca3Q8R420 1704 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Igsf1Q7TQA1 1317 aa10.2□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rbm46P86049 533 aa10.19□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nutm1Q8BHP2 1126 aa10.19□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tgfb2P27090 414 aa10.19□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 CrklP47941 303 aa10.19□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 InsrP15208 1372 aa10.19□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nkx1-1G3UXB3 402 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nectin2P32507 530 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc60Q8C4J0 545 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 FktnQ8R507 461 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 FocadA2AKG8 1798 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Megf6Q80V70 1572 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pibf1E9Q6K3 756 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Col23a1Q8K4G2 532 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Dennd6aQ8BH65 605 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Camkk2Q8C078 588 aa10.18□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Irx6Q9ER75 438 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map3k19E9Q3S4 1311 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gja3Q64448 417 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 OptnQ8K3K8 584 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 PalmQ9Z0P4 383 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Slc12a5Q91V14 1138 aa10.17□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cyp2c69E9PXC3 491 aa10.16□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cyp2c40P56657 491 aa10.16□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Trim58Q5NCC9 485 aa10.16□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 NogP97466 232 aa10.15□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mcm10Q0VBD2 885 aa10.15□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tshz2Q68FE9 1030 aa10.15□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Eftud2-201ENSMUST00000021306 ArsiQ32KI9 573 aa10.15□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nlgn1Q99K10 843 aa10.15□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Klhdc4Q921I2 584 aa10.14□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Prom2Q3UUY6 835 aa10.14□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ano8Q6PB70 1060 aa10.14□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 SobpQ0P5V2 864 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Sned1Q70E20 1403 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Akap2O54931 893 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Spata31d1bE9QA57 1361 aa10.13□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ppp1r1bQ60829 194 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cavin4A2AMM0 362 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 AU015836B2RUM3 263 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Msl1Q6PDM1 616 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map2P20357 1828 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 MpripP97434 1024 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cabp4Q8VHC5 271 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Klc3Q91W40 508 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cabp2Q9JLK4 216 aa10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa10.11□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 NudcO35685 332 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zranb3Q6NZP1 1069 aa10.11□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 TkfcQ8VC30 578 aa10.11□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 PgfP49764 158 aa10.11□□□□□ -0.79
Eftud2-201ENSMUST00000021306 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms