Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX8Q9Y5X2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms