Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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