Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F4

TOGARAM1, TOG array regulator of axonemal microtubules protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOGARAM1Q9Y4F4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOGARAM1Q9Y4F4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms