Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF5Q9Y2D1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF5Q9Y2D1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms