Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms