Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AMFRQ9UKV5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AMFRQ9UKV5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms