Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PACSIN3Q9UKS6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PACSIN3Q9UKS6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms