Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms