Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN4Q9UJW0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN4Q9UJW0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms