Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHF11Q9UIL8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms