Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA3Q9UI47 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA3Q9UI47 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms