Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHORDC1Q9UHD1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms