Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPC1L1Q9UHC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPC1L1Q9UHC9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms