Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EXTL2Q9UBQ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms