Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRBP1Q9P2E9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms