Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms