Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMOD3Q9NYL9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms