Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CWC25Q9NXE8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CWC25Q9NXE8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms