Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF2Q9NX18 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms