Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLN6Q9NWW5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN6Q9NWW5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms