Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB6BQ9NRW1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms