Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2B1Q9NRF2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms