Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEBOXQ9HB31 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms