Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms