Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLSTN2Q9H4D0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLSTN2Q9H4D0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms