Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPH6AQ9H0K4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPH6AQ9H0K4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms