Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CELF4Q9BZC1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms