Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms