Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR3

KRTAP4-4, Keratin-associated protein 4-4, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-4Q9BYR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AL132639.2-201ENST00000605298 1359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ALDOB-203ENST00000616752 1391 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CCNH-203ENST00000504878 1497 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 HIST1H2BC-201ENST00000314332 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
KRTAP4-4Q9BYR3 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms