Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SMIM2Q9BVW6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms