Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TIMM29Q9BSF4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms