Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GINS3Q9BRX5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms