Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ECSITQ9BQ95 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECSITQ9BQ95 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms