Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CITED2Q99967 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CITED2Q99967 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms