Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MYD88Q99836 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms