Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GPA33Q99795 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPA33Q99795 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms