Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MEIS3Q99687 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms